在交通肇事事故中，侵权行为人对受害人作出的赔偿协议仅有单方签字是无效的。肇事赔偿协议属于合同的性质，而一份合同必须要双方的签字才可以生效，只有一方签字的合同，合同并未成立。因此赔偿协议无效，需要重新签订赔偿协议或者调解书。

《民法典》第四百七十条
合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：
（一）当事人的姓名或者名称和住所；
（二）标的；
（三）数量；
（四）质量；
（五）价款或者报酬；
（六）履行期限、地点和方式；
（七）违约责任；
（八）解决争议的方法。
当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。