投资合同纠纷处理方式与一般合同纠纷处理方式区别不大。
可以通过清算、协商的方式，将各方收益结算清楚。
按照合同约定的争议解决方式或者以及法律规定的方式解决。
合同双方当事人可以自行协商，相关部门进行调解，协商、调解不成的申请仲裁机构裁决，或向法院起诉。

《中华人民共和国民法典》第四百六十四条
合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。
婚姻、收养、监护等有关身份关系的协议，适用有关该身份关系的法律规定；
没有规定的，可以根据其性质参照适用本编规定。