如果因建设工程合同发生纠纷，首先应当注意该工程合同是否有效，若有效，再进一步分析是否能够根据合同约定的内容维护自身权益，比如要求对方支付工程款、承担违约责任等。需要注意的是，建筑工程总承包单位可以将承包工程中的部分工程发包给具有相应资质条件的分包单位。但实践中往往因为资质问题造成多数都是违法分包，因而该分包合同也会被认定无效。不过，工程分包合同无效的，只要已完成工程质量合格，实际施工人既可以选择向承包人追讨工程款，也可以选择要求发包人支付相应的工程款。在追索拖欠工程款时，如果该工程尚未竣工，可以向法院申请对在建工程申请造价鉴定。

《民法典》第五百零二条
依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。
依照法律、行政法规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的，不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。应当办理申请批准等手续的当事人未履行义务的，对方可以请求其承担违反该义务的责任。
依照法律、行政法规的规定，合同的变更、转让、解除等情形应当办理批准等手续的，适用前款规定。