补充协议和主合同具有同等法律效力。与主合同不一致的地方，一般以补充协议为准。房屋买卖补充协议是否有效，首先要看主合同是否有效。如果主合同无效，签订的房屋买卖补充协议也无效；如果主合同有效，补充协议的内容不违反法律、法规的强制性规定的，补充协议有效。
法律依据：
《合同法》第44条
依法成立的合同，自成立时生效。