在一般的司法实践中，除非相关法律法规就公章的备案有所明确规定之外，非经注册备案所刻制的公章并不会直接导致相应合同的无效性。
但是，若有充足证据表明该公章是由公司实际应用或是得到公司明确授权、许可的情况下所印鉴，这种情况下所订立的合同亦或是被认定为有效的。
然而，倘若相对方已经清楚地了解到该公章尚未进行注册备案，并且在使用过程中违反了公司内部的常规操作流程，那么这将对合同的有效性产生一定程度上的不利影响。

《中华人民共和国民法典》第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。