通常情况下部分条款无效不会导致整个协议无效。
一般经过双方协商一致后，合同更改后仍可继续完全生效。如协商不一致，则仅部分条款无效。部分条款可以作为相对独立的组成部分，其无效后有法律规定的按照法律规定履行，没有法律规定的按照行业惯例履行。
但是三个例外情况如下：
1、部分条款违反了国家安全，或泄露国家机密等等的话，合同无效。
2、部分条款属于合同八个主要条款如当事人姓名住所、标的数量质量等之一。
3、合同订立时，当事人一方被胁迫，在非自愿情况下签订合同的。
符合以上三点，合同自始无效。

《民法典》第一百五十六条
民事法律行为部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。
《民法典》第一百五十三条
违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。违背公序良俗的民事法律行为无效。