分公司签订的转让合同是否有效要看合同的签订主体是否有效。并不是所有的分公司都可以签订合同，只有有营业执照的分公司才可以是对外以自己的名义签订合同，成为民事诉讼当事人。如果分公司无权签订合同，则未经总公司同意或者授权，擅自转让合同是无效的。

《民事诉讼法》第四十九条
规定的其他组织是指合法成立、有一定的组织机构和财产，但又不具备法人资格的组织，包括：
（1）依法登记领取营业执照的私营独资企业、合伙组织；
（2）依法登记领取营业执照的合伙型联营企业；
（3）依法登记领取我国营业执照的中外合作经营企业、外资企业；
（4）经民政部门核准登记领取社会团体登记证的社会团体；
（5）法人依法设立并领取营业执照的分支机构；
（6）中国人民银行、各专业银行设在各地的分支机构；
（7）中国人民保险公司设在各地的分支机构；
（8）经核准登记领取营业执照的乡镇、街道、村办企业；
（9）符合本条规定条件的其他组织。