没关系，有房产证后买卖合同一般就用不上了，但建议还是保存。房屋买卖合同就是一般的买卖合同，是债权行为。一般来说，房屋买卖合同的作用在于能够证明房产证存在的合法性，因为物权关系的存在的基础在很多情况下是债权关系。
《民法典》第二百零九条：不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。