在当事人发起民事诉讼，特别是因借款协议引发的诉讼中，依照相关法律法规的要求，必须按时缴纳相应的案件受理费用。
然而，若涉及到财产权益纠纷的案件，除需按规定支付案件受理费用之外，还须按照特定程序缴纳其他必要的诉讼费用。
对于经济上的确存在实际困难的涉案当事人，可依据法律规定向法院提交申请，申请延后或减少缴纳，甚至予以免除诉讼费用。
有关具体的诉讼费用收取方法及细则，将由法律部门另行制定并颁布施行。
所以，当我们面对借款协议产生的纠纷，申请诉讼时所需要支付的起诉费用，应综合考虑案件的具体状况，以现行法律规定和法院的收费标准为参考依据进行合理计算。

《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十一条
当事人进行民事诉讼，应当按照规定交纳案件受理费。财产案件除交纳案件受理费外，并按照规定交纳其他诉讼费用。
当事人交纳诉讼费用确有困难的，可以按照规定向人民法院申请缓交、减交或者免交。
收取诉讼费用的办法另行制定。