如果双方是事实婚姻，并且有了孩子的话，原则上是应该到婚姻登记机关结婚的，但往往也会有不想再生活在一起的情况，那么这时候孩子的抚养权由父母协商解决，如果无法达成一致协议的则可以向法院起诉。
《民法典》第一千零四十九条：要求结婚的男女双方应当亲自到婚姻登记机关申请结婚登记。符合本法规定的，予以登记，发给结婚证。完成结婚登记，即确立婚姻关系。未办理结婚登记的，应当补办登记。