对于小产权房的分割，夫妻双方可以就归属以及对不获得所有权一方的财产补充进行协商，协商一致的约定在离婚协议中即可。
如果双方无法协商一致起诉到法院之后，在离婚纠纷中要求法院来分割的。
由于小产权房的分割涉及到国家房产登记规定、各地房产限购政策的约束，双方较难就归属价款股问题协商一致，法院也很难直接进行分割。
有些法院还会选择以要求双方当事人另案起诉，在离婚案件中不作处理，或者有些法院会先对房屋的使用权进行处理，并告知，在当事人可以在产权完备后，请求另行分割。

《民法典》第一千零八十七条
离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；
协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。