夫妻分居满三年并不会导致自然离婚情况的出现。
事实上，无论夫妻分居时间长达多少年，始终无法达到自动解除婚姻关系的目的。
根据我国现行法律规定，离婚仅存在协议离婚及诉讼离婚这两种途径。
因此，若未按照相关程序进行离婚登记，或者未经由法院依法作出判决，夫妻之间始终被视为未正式离婚，无论分居期如何长久。
然而，如若双方确实因情感不合，并已持续分居超过两年时间，在此情形下向法院提出离婚诉讼时，便可作为证明夫妻情感破裂的重要指标。
如法院经调解后依旧判定无果，则将作出离婚判决。

《民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。