针对购买期房并支付首付款但发现房屋五证不齐的情况，一般的处理方式是可以申请退回款项。签订合同之后，双方都应按照约定履行各自的义务。如果作为买方的您在约定时间内未能获得房屋的不动产权属证书，那么卖方则应当承担相应的法律责任和违约赔偿。

《最高人民法院关于审理商品房买卖合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》第十四条由于出卖人的原因，买受人在下列期限届满未能取得不动产权属证书的，除当事人有特殊约定外，出卖人应当承担违约责任：（一）商品房买卖合同约定的办理不动产登记的期限；（二）商品房买卖合同的标的物为尚未建成房屋的，自房屋交付使用之日起90日；（三）商品房买卖合同的标的物为已竣工房屋的，自合同订立之日起90日。合同没有约定违约金或者损失数额难以确定的，可以按照已付购房款总额，参照中国人民银行规定的金融机构计收逾期贷款利息的标准计算。