依据我国现行法律法规以及商业交易惯例的规范，每日百分之三的违约金通常采用以下方式进行计算：即将本金数值与百分之三相乘。违约金作为一种新型的契约经济手段，同时也是对违约行为实施的经济惩戒措施之一。其设立的初衷在于确保债务的顺利履行。而关于违约金具体数额的确定，则需依照法律规定或者由双方当事人在合同中以书面形式予以明确约定。

《民法典》第五百八十五条当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。