在房产交易中，由中介机构代为妥善保管定金的行为，是具有合法效力的。通常情况下，定金应当由售房者直接接收。然而，如今的房产交易实践中，买卖各方可能会达成协议，将定金委托给中介机构进行保管。这种做法并未违反任何现行的法律法规，因此仍然被视为有效的约定方式。根据相关法律规定，如果当事人之间约定将支付定金作为主合同成立或生效的必要条件之一，那么即使支付定金的一方未能实际支付定金，只要主合同已经开始执行或者其主要内容已经得到了履行，都不会对主合同的成立或生效产生实质性的影响。

《中华人民共和国民法典》第五百八十六条当事人可以约定一方向对方给付定金作为债权的担保。定金合同自实际交付定金时成立。定金的数额由当事人约定；但是，不得超过主合同标的额的百分之二十，超过部分不产生定金的效力。实际交付的定金数额多于或者少于约定数额的，视为变更约定的定金数额。