对于房屋产权证书未能按时办理所产生的违约情况，按照合法规定应依据签订的合约中的明确条款来计算赔偿金。违约金作为一种约定的违约行为承担方式，在支付完毕违约金后，若在合约中有约定违约金的标准，则需按此标准向另一位当事人支付相应的赔偿金。双方在拟定购房合同时若直接对违约金的具体数额做出了清晰的规定，违约方无疑需要遵照约定数额如数支付；反之若只在合约中粗略地提及了违约金的计算方法，当一方发生违约现象后，需根据市场行情等因素通过既定方法得出违约金的精确数额，然后由违约方负责支付。在违约方履行支付义务时，如发现违约金的金额过高甚至超过其实际损失的30%，该方有权请求仲裁机构或法院适当减少；而乙方如果认为违约金金额过低，则可请求仲裁机构或法院适度提高，并要求违约方支付与实际损失相当的数额。

《中华人民共和国民法典》第五百八十五条
当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。