关于房产证逾期申请办理所涉及到的违约金问题，通常应遵循房屋买卖合同中的相关规定来计算。违约金是一种通过合同约定确立起来的违约责任形式，当一方因延迟履行而发生违约行为时，需对另一方依照合同之约定支付给其相应数量的违约金。若双方在签订合同时已明确了违约赔偿金的具体数值，那么违约方必须按照此金额来支付；反之，如合同只规定了违约金的计算方式，则在违约事件发生之后，一方需根据合约规定的算法计算出违约赔偿金的实际数额，然后依据这个数字赔偿给另一方。当然，在支付违约金过程中，如果发现违约赔偿金已然大大超过了损失承受力，此时就有权向相关仲裁机构或法院提出调整请求，这里所谓的“过高”是指违约金的数额已经超越了损失数额的30%。同样地，若违约方认为违约金的金额过低，无法弥补其实际经济损失，也可依法提出增加违约金要求并获得支持，直至满足与损失相同的额度为止。

《中华人民共和国民法典》第五百八十五条
当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。