关于房产证书逾期办理所涉及的违约金赔偿问题，根据相关法律法规和合同条款的规定，应严格遵循合同的约定进行相应计算。违约金是为预防和解决各种不确定风险而预设的约定性违约责任承担方式，若出现一方当事人违反约定导致产生违约金，合同中所约定的违约金应由违约方支付给另一方当事人。具体来说，如果双方在购房合同时已经直接约定了违约金的具体金额，则违约方应按照既定的数额来承担违约金；若是在合同中明确规定了违约金的计算方法，违约方则需在实际违约之后，依据约定的运算规则得出具体的违约金数额，然后按此数值履行付款义务。值得注意的是，当违约方在支付违约金的过程中发现其数额过高并且超过实际损失的30%时，有权提请申请仲裁机构或人民法院对此进行适当减损；反之，若收取违约金的一方认为违约金数额过低且不能弥补损失时，亦可请求仲裁机构或人民法院对此予以适度提高，直至与实际损失相当。

《中华人民共和国民法典》第五百八十五条
当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。