通常来讲，商铺的层高和当初签订的合同不一致时，并不一定就能立刻办理退房手续。
这得要看具体的合同条款以及层高的差异大小。
要是合同里面清清楚楚地写明了商铺层高的具体标准，可实际交过来的层高跟合同上相差特别大，大到已经严重影响到了商铺的使用功能，或者让商铺的价值大幅度降低了，并且这种差异根本没办法通过其他办法来弥补，那客户就有权利要求解除合同然后退房。
不过，如果层高的差异比较小，压根不会影响到商铺的基本使用，又或者合同里面对于层高的差异有一个比较合理的容忍范围规定，那可能就不能仅仅因为这个层高差异就去要求退房。
客户最先可以和开发商好好商量一下，让他们想想办法采取一些补救措施，或者给咱一些相应的补偿。
要是商量不来，那就可以按照合同里约定的争议解决办法，要么通过仲裁，要么去打官司来解决这个问题。