为配偶在房产证上减少名额应遵循如下程序：
首先，需要本人持有效之身份证件、户籍证明文件以及夫妻关系证明证件、房产所有权证书等文档前往房地产过户登记机关申请办理不动产变更登记手续。
其次，不动产登记部门将对申请人递交的相关资料进行严格的审核和查验，若核实无误且符合处理条件，将会展开相应的不动产变更登记操作，同时向申请人发放新的房产所有权证明书。

《民法典》第二百零九条
不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。
依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。
第二百一十条不动产登记，由不动产所在地的登记机构办理。
国家对不动产实行统一登记制度。统一登记的范围、登记机构和登记办法，由法律、行政法规规定。
第二百一十四条不动产物权的设立、变更、转让和消灭，依照法律规定应当登记的，自记载于不动产登记簿时发生效力。