90平方米的房产在申请办理房产证书时所须支付的各项费用的标准如下：
首先是针对位于居民区内的住房每套收取人民币80元的手续费；如果该房产还拥有附属的共有权证明书，则需额外增加工本费10元/本。接着是针对其他类型房产（例如：
商业用房、办公楼等）所进行的收费：
对于建筑面积低于或等于500平方米的房产，每宗交易收取200元的手续费；若房产建筑面积介于500至1000平方米之间，则需收取的手续费为300元/宗；当房产建筑面积大于或等于1000但少于2000平方米时，手续费将增加到500元/宗；当房产建筑面积介于2000至5000平方米时，手续费为800元/宗；而对于建筑面积超过5000平方米的房产来说，手续费则提高到了1000元/宗级别；同样，如果该类房产还拥有附属的共有权证明书，则需额外增加工本费10元/本。

《民法典》第二百零九条规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。
《民法典》第二百一十七条规定，不动产权属证书是权利人享有该不动产物权的证明。不动产权属证书记载的事项，应当与不动产登记簿一致；记载不一致的，除有证据证明不动产登记簿确有错误外，以不动产登记簿为准。