父亲房子过户给儿子最省钱的方式是继承。以继承方式过户房产只需缴纳一定比例的印花税、公证费和工本费，不需要缴纳其他税费。以赠与方式过户房产需要额外缴纳3%的契税以及0.05%的印花税，以买卖方式过户房产主要涉及3%的契税、差价5.6%（未满2年）的增值税、房款1%的个人所得税。

《契税法》第三条
契税税率为百分之三至百分之五。
契税的具体适用税率，由省、自治区、直辖市人民政府在前款规定的税率幅度内提出，报同级人民代表大会常务委员会决定，并报全国人民代表大会常务委员会和国务院备案。省、自治区、直辖市可以依照前款规定的程序对不同主体、不同地区、不同类型的住房的权属转移确定差别税率。
《印花税暂行条例》第五条
印花税实行由纳税人根据规定自行计算应纳税额，购买并一次贴足印花税票的缴纳办法。为简化贴花手续，应纳税额较大或者贴花次数频繁的，纳税人可向税务机关提出申请，采取以缴款书代替贴花或者按期汇总缴纳的办法。