农村房屋所有权证办理程序：
1、由房管局对农村房屋进行测绘。
2、发放自建房屋申请表并交由村委会盖章。
3、申请人携带土地证和身份证及相关材料到房管局申请办理房产证，农村房屋所有权证办理完毕。
房屋所有权证是购房者通过交易，取得房屋的合法所有权，可依法对所购房屋行使占有、使用、收益和处分的权利的证件。

《民法典》第二百零九条
不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；
未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。
第二百一十一条
当事人申请登记，应当根据不同登记事项提供权属证明和不动产界址、面积等必要材料。