非法占有房屋的损失可以要求占有人赔偿：
可以要求停止侵害，赔偿损失，对于损失，受侵害人需要有证据证明。
可以通过诉讼程序解决。
事诉讼第一审程序：
1、起诉，即向有管辖权的法院立案庭递交诉状。
2、立案审查符合立案条件，通知当事人7日内交诉讼费，交费后予以立案；
不符合立案条件，裁定不予受理。
如果对裁定驳回起诉不服，10日内向上级人民法院提出上诉。
受理后，法院5日内将起诉状副本送达对方当事人，对方当事人15日内进行答辩，通知当事人进行证据交换，可根据当事人申请，做出财产保全裁定，并立即开始执行3、排期开庭提前3日通知当事人开庭时间、地点、承办人；
公开审理的案件提前3日进行公告。
4、开庭审理宣布开庭，核对当事人身份，宣布合议庭成员，告知当事人权利义务，询问是否申请回避法庭调查：
当事人陈述案件事实。
举证质证：
告知证人的权利义务，证人作证，宣读未到庭的证人证言，出示书证、物证和视听资料；
双方当事人就证据材料发表意见。
法庭辩论：
各方当事人就有争议的事实和法律问题，进行辩驳和论证。
法庭调解：
在法庭主持下，双方当事人协议解决纠纷。
如果达成调解协议，制作调解书，双方当事人签收后生效，当事人履行调解书内容或申请执行；
未达成调解协议，合议庭合议作出裁决(宣判)。
5、宣判同意判决，当事人自动履行裁判文书确定的义务或向我院告诉庭提出执行申请；
不同意裁判，需要分情形区分对待：
裁定：
送达之日起10日内向上级人民法院提出上诉；
判决：
送达之日起15日内向上级人民法院提出上诉。

《土地管理法》第七十六条
未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府土地行政主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，对符合土地利用总体规划的，没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处罚款；
对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予行政处分；
构成犯罪的，依法追究刑事责任。