二手房商铺过户的费用如下：
一、卖方。
1、营业税5.5%（房产证满五年可免)；
2、个人所得税1%（房产证满五年且是唯一一套住房可免)，（90平方以上要交印花税0.05%)；
3、土地交易服务费3元每平方。
二、买方。
1、契税1%（90平方以上144平方以下1.5%.非普通住宅/144平方以上3%)；
2、土地交易服务费3元每平方（90平方以上要交印花税0.05%)；
3、登记费50元每人。

《房屋登记办法》第八十六条
房屋所有权依法发生转移，申请房屋所有权转移登记的，应当提交下列材料：
（一)登记申请书；
（二)申请人的身份证明；
（三)房屋所有权证书；
（四)宅基地使用权证明或者集体所有建设用地使用权证明；
（五)证明房屋所有权发生转移的材料；
（六)其他必要材料。
申请村民住房所有权转移登记的，还应当提交农村集体经济组织同意转移的证明材料。
农村集体经济组织申请房屋所有权转移登记的，还应当提交经村民会议同意或者由村民会议授权经村民代表会议同意的证明材料。