关于购房合同中违约赔偿金的核算方式，这通常是依据于合同中的明确规定进行计算的。
倘若在合同当中已经详细列明了违约赔偿的计算公式或具体金额，那么便应严格按照合同的约定来执行处理。
至于在合同中未对违约赔偿问题作出明确规定的情况下，一般的做法是以违约行为所导致的实际损失作为基础，其中既包含了直接损失（例如因为违约而额外产生的费用支出），也涵盖了间接损失（比如预计能够获得的利益受到损害时的损失额）。
在此过程中，法院将会全面权衡各种相关因素，例如合同的履行状况、违约方的过失程度以及预期利益等等。
总的来说，违约赔偿金的数额原则上应该与违约行为所带来的实际损失相匹配，但是其总额度不能超过签订合同时所能预见或者应当预见到的因违反合同可能引发的损失。
因此，具体的计算方法必须要根据每一个案件的具体情况以及相关的证据材料来加以确定。