营业执照异常的处理方式如下：
一、如果因为没有按照规定履行义务导致异常的，则要将相关义务履行完毕，然后申请移出异常名录。
二、如果是因为经营场所变更导致的，则要进行经营场所变更登记，然后申请移出经营异常名录。

《企业经营异常名录管理暂行办法》第十条
被列入经营异常名录的企业自列入之日起3年内依照《企业信息公示暂行条例》规定履行公示义务的，可以向作出列入决定的工商行政管理部门申请移出经营异常名录。
工商行政管理部门依照前款规定将企业移出经营异常名录的，应当作出移出决定，并通过企业信用信息公示系统公示。移出决定应当包括企业名称、注册号、移出日期、移出事由、作出决定机关。