营运车辆被扣押之后所产生的损失，通常是能够按照相关的法律规定来进行妥善处理的。
首先，必须清晰地明确扣押该营运车辆的原因是什么，以及依据的是哪项法律法规。
如果发现扣押行为本身是违法的，那么车主就可以通过申请行政复议或者提起行政诉讼等方式，要求相关部门解除扣押措施，并且对其所遭受的损失进行赔偿。
倘若扣押行为是合法的，那就需要根据具体的实际情况来确定损失赔偿的责任方。
一般情况下，由于扣押而导致的营运车辆停运所产生的损失，应当由实施扣押行为的机关或者与之相关的责任人来承担赔偿责任。
赔偿的范围涵盖了车辆在停运期间的合理停运损失，比如说因为停运而使得营业收入减少的那部分金额等。
不过，车主需要提供足够充分的证据，以此来证明损失的具体数额到底是多少。
同时，也不能忽略车辆本身存在折旧等因素对损失的影响。
在整个处理的过程当中，车主可以与相关的各方进行友好的协商沟通。
如果协商无法达成一致意见，那么车主就可以借助法律途径，通过向法院提起诉讼等方式，来维护自身的合法权益。