担保协议一般会加盖机构公章或合同专用章。
对于机构来说，公章代表着机构对外做出决策的合法权益；
而合同专用章则专门适用于签署合约，此盖章行为亦可显示出机构的担保意向。
不过，无论选用哪种形式的公章，都需要严格遵守机构内部的管理规范和相关的法律法规。

《中华人民共和国民法典》第四百九十条
当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
法律、行政法规规定或者当事人约定合同应当采用书面形式订立，当事人未采用书面形式但是一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。