若合同章未位于特定位置，一般而言，该情况并不会对合同注销登记的程序产生立即的不利影响。
在进行合同的注销处理中，关键环节在于明确合同履行状况，以及债务清偿等方面的事项。
倘若合同已圆满履行完毕并且不存在任何争端，那么通常可根据正常的注销步骤展开相关工作。
然而，如因印章放置位置不当引发合同法律效力之疑虑，便需先行解决相关矛盾冲突，进而推进注销手续的办理。

《企业法人登记管理条例》第二十一条
企业法人办理注销登记，应当提交法定代表人签署的申请注销登记报告、主管部门或者审批机关的批准文件、清理债务完结的证明或者清算组织负责清理债权债务的文件。经登记主管机关核准后，收缴《企业法人营业执照》、《企业法人营业执照》副本，收缴公章，并将注销登记情况告知其开户银行。