合同与协议在法律上的区别主要是法律性质不一样。
具体而言，婚姻、收养、监护等有关身份关系的协议，适用其他法律的规定，协议绝大多数是合同，只有涉及婚姻、收养、监护等有关身份关系的协议不适用民法典，这些协议也就不能称之为法律上或者民法典上的合同而称之为其他协议。

《中华人民共和国民法典》第四百六十三条本编调整因合同产生的民事关系。
第四百六十四条合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。
婚姻、收养、监护等有关身份关系的协议，适用有关该身份关系的法律规定；
没有规定的，可以根据其性质参照适用本编规定。