有债务的企业能否申请注销，这需要根据具体情况来分析：
一、一般情况不能直接注销
通常而言，当企业存在未清偿的债务时，是不可以直接进行注销操作的。
企业注销意味着其法人资格就此终止，一旦注销完成，企业便无法再以自身名义去承担债务。
例如，企业向银行借款尚未还清，如果此时注销，银行的债权就难以得到保障，这无疑会损害到债权人的利益。
所以，在这种常规情况下，为了保护债权人的合法权益，有债务未清偿的企业不能随意注销。
二、注销前需合法处理债务
若企业确实有注销的需求，那么必须先对债务进行合法且妥善的处理。
具体方式有多种，一是与债权人进行充分的协商，共同制定出合理的债务清偿计划，并且按照计划切实履行完毕相关清偿义务；二是在获得债权人同意的前提下，将债务进行合法的转移，确保债务有明确的承担主体。
三、破产清算后可依法注销
当企业进入破产清算程序后，需要依照法律规定进行清算。
在清偿完破产费用、共益债务、职工债权以及税款等一系列法定债务后，即便此时仍然存在未清偿的债务，企业也可以依据相关法律规定申请注销。
总之，有债务的企业若要注销，一定要妥善处理好债务问题，严格遵循法定程序，避免对债权人权益造成损害。

案情回顾:

小朱开办的企业因经营不善欠下银行贷款，后小朱想注销企业，银行表示反对，争议点在于有债务的企业能否注销。小朱试图直接注销，银行维权。后小朱尝试与银行协商清偿计划，未达成一致。小朱又考虑破产清算后注销。

案情分析:

1、小朱的企业有未清偿银行贷款债务时，不能直接注销，因注销后法人资格终止，无法承担债务，会损害银行作为债权人的利益。
2、小朱应与银行协商制定合理清偿计划并履行义务，或经银行同意合法转移债务，否则不能随意注销。
3、若企业进入破产清算程序，清偿法定债务后，即便有未清偿债务，也可依法申请注销。