自然人投资控股法人时，通常要承担以下这些责任：
①在民事责任方面：一般来说，是以自身的出资额为界限来对法人所负的债务承担有限责任的。
倘若法人出现了对外欠债的情况，当法人自身的财产没办法完全清偿这些债务时，那么自然人仅仅需要用自己出资的那部分财产去承担责任就行，而其自身的其他财产是不会受到任何影响的。
比如说，一个人出资100万控股了一家公司，公司对外欠了200万，在公司财产只有150万的情况下，这个人只需用自己的100万出资来偿还债务，其余的50万债务就与他无关。
②关于行政责任：要是法人出现了违法违规的行为，像是偷税漏税或者环境污染之类的情况，作为控股股东的自然人，很可能会因为管理不善等原因而被要求承担行政责任。
比如可能会被处以罚款，金额根据违法的严重程度而定；严重的话，还可能会被吊销执照，导致公司无法继续经营。
③对于刑事责任：倘若法人构成了犯罪，像诈骗、走私等这类罪行，控股股东有可能因为参与了犯罪的决策、组织或者实施等行为，而被追究刑事责任，进而面临着被判处监禁等刑罚的后果。
总之，虽然自然人在投资控股法人时是以自己的出资为限度来承担责任的，但在某些特定的情况下，还是有可能需要对法人的债务等问题承担相应的责任。

案情回顾:

小朱出资200万控股一家公司，后公司对外欠债500万，公司财产仅300万。小朱认为自己只需用200万出资偿债，剩余债务无关。此外，该公司因偷税漏税被查，小朱觉得不应承担行政责任，争议由此产生。

案情分析:

1、在民事责任方面，根据相关规定，小朱以出资额为限承担责任，即只需用200万出资偿还公司债务，剩余债务无需其个人财产偿还。
2、关于行政责任，公司存在偷税漏税违法违规行为，作为控股股东的小朱，可能因管理不善等原因被要求承担行政责任，如被处以罚款，严重时可能被吊销执照。
3、若公司构成犯罪，小朱若参与犯罪决策、组织或实施等行为，将被追究刑事责任，面临监禁等刑罚。