关于违反协议约定事项的诉讼时效问题是具有明确法律依据的。
按照通常的规定，当权利人知晓或者预计其民事权益可能会遭受侵害时，便有责任在法律规定的时间内请求法院进行保护，这一期限为3年。
然而，在法律有所特别规定的情况下，我们必须遵从其具体规定。
具体来说，侵权行为所产生的诉讼时效时间是从权利人实际获悉其诉讼权受到损害以及负有相关义务的人之日开始起算。
值得注意的是，在某些特殊情形下，例如当事人双方约定将同一项债务分若干阶段加以清偿的，那么诉讼时效期间就应当自最后一期债务履行期限届满之日起计算。
然而需要谨记的是，一旦诉讼时效期间届满，义务方有权以未能履行相关义务为抗辩理由。
另外，人民法院并不能主动援引诉讼时效的规定来处理案件。
总的来说，当您遇到协议违约事件时，务必及时主张自己的合法权益，以便于避免超出诉讼时效那一不可挽回的后果。