股权转让协议被认定为无效之情形常有以下数种：
一是，当某一方当事人恶意地采用欺骗或威胁等不正当手段来缔结该协议，从而对国家利益造成了实质性的损害；
二是，当双方当事人之间存在着明知故犯、蓄意串谋的行为，并且这种行为直接或间接地损害到了国家、集体或第三方的利益；
三是，当某一方当事人通过看似合法的形式来掩饰其真实的非法目的；
四是，当该协议的达成严重损害了社会公共利益；
五是，当该协议的内容违反了法律、行政法规中的强制性规定。
例如，若转让方故意向受让方隐瞒了公司所背负的重大债务，使得受让方在毫不知情的情况下签署了该协议，那么这一行为便极有可能导致该协议被判定为无效。

《中华人民共和国民法典》第一百四十四条
无民事行为能力人实施的民事法律行为无效。