若工程项目部门未能按时偿还债务，权利方（债权人）有权寻求我国司法机构的援助，向人民法院发起诉讼，以维护自身合法权益。
关于诉讼时限的规定，我国法律规定，诉讼时效期限为三年，自权利方明确知晓或应当知晓自身权益受损及义务方之日起开始计算。
然而，若超过二十年，则人民法院将不再提供保护，除非存在特殊情形，人民法院可依据权利方的申请酌情予以延长。
因此，若债权人在得知或应当得知自身权益受损之后，能够在诉讼时效期限内及时提起诉讼，便有权向工程项目部门提出还款要求。
反之，若超过诉讼时效期限，债权人可能会失去通过司法途径追讨欠款的法定权利。

《中华人民共和国民法典》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。