在处理医疗纠纷方面，适用诉讼时效期的是三年的期限。依据我国现行的法律规定，对于涉及到公民、法人或其他组织向人民法院申请保护其民事权益的案件，诉讼时效期设定为三年。然而，若法律另有特别规定的情况下，则应按照该特殊规定执行。诉讼时效期的起算时间是从权利人明确知晓或应当知晓自身权益受到了损害，并且明确了义务人之日开始计算。

《民法典》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。