医疗纠纷处理的程序如下：
1、首先医患双方可以进行协商调解，调解不成的，医患任何一方均可向主管卫生行政部门提出处理请求。
2、卫生行政部门受理后会给出处理意见，一般会再次协商调解。
3、如对处理结果仍不服的，可以向当地基层人民法院提起诉讼。

《医疗纠纷预防和处理条例》第二十二条
发生医疗纠纷，医患双方可以通过下列途径解决：
双方自愿协商；
申请人民调解；
申请行政调解；
向人民法院提起诉讼；
法律、法规规定的其他途径。