当遭遇医疗事故导致二级伤残时，赔偿主要涵盖以下一些方面。
医疗费方面，要严格按照实际发生的费用来计算，并且必须要有相关的医疗凭证作为支撑，这样才能确保赔偿的合理性。
护理费的确定，要综合考虑护理人员的收入状况以及护理所持续的期限，这样能准确体现护理所需的费用。
误工费则是以受害人因为误工而减少的收入为依据进行计算，同时需要提供详细的误工证明等材料，以证明误工的事实和损失的额度。
残疾生活补助费根据伤残等级来确定，按照当地居民的年平均生活费进行计算，从定残之月起开始赔偿，一般为二十年。
除此之外，还可能会有精神损害抚慰金等项目，其具体的数额会根据案件的具体情况来进行判定。
在这个过程中，患者及其家属可以与医疗机构进行协商，共同商讨赔偿的事宜。
如果协商不成，还可以向卫生行政部门申请调解，或者直接向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自身的合法权益。
需要特别注意的是，整个赔偿过程必须依据相关的法律法规以及医疗事故的鉴定结论来进行，以确保赔偿的公平、公正和合法。