分居两年起诉离婚的程序具体如下：
1、首先，要明确有管辖权的法院是哪一个。
接着，向该法院提起离婚诉讼，认真撰写起诉状，将自己的诉求清晰地表达出来，同时要准备好相关证据，比如能够证明分居的各种材料，像水电费缴费单、租赁合同等，这些都可以作为分居的有力证明。
法院收到起诉材料后，会进行严格的审查，以确定是否符合受理条件，若符合则会予以受理。
2、受理之后，法院会根据工作安排合理地确定开庭时间，并通过法定方式通知双方当事人。
到了开庭这天，双方都必须按时到庭，在法庭上详细地陈述自己的意见，并且要积极提供对自己有利的证据。
3、法庭会对整个案件进行全面的审理，深入调查分居的事实以及其他相关情况。
如果经过审理，认定分居已经达到两年，且符合法定的离婚条件，那么法院就会作出离婚判决。
在整个起诉离婚的过程中，收集和保存证据是非常关键的，这直接关系到自己的主张能否得到支持。
同时，双方都要严格遵守法院的程序和规定，按时参加诉讼活动，积极配合法院的工作。
如果遇到比较复杂的情况，为了更好地维护自己的权益，建议聘请专业的律师协助处理。
案情回顾:
小朱和小李因感情不和分居两年，小朱向有管辖权的法院提起离婚诉讼，认真撰写起诉状并准备好水电费缴费单等分居证据。法院受理后确定开庭时间并通知双方，开庭时双方都需按时到庭陈述意见并提供证据。
案情分析:
1、小朱明确诉讼流程，精心准备证据，法院依法受理，为后续审理奠定基础。
2、开庭时双方应积极配合，如实陈述，法庭全面审理分居事实等情况，若符合条件则作出离婚判决。整个过程中证据收集和遵守程序至关重要，可聘请律师协助以维护自身权益。