长期分居的如何办理离婚手续要看双方选择何种方式离婚。
如果选择诉讼的方式离婚的，需要下列手续：
（一）一方写好起诉状然后向被告住所地或者经常居住地的法院提起离婚诉讼。
（二）起诉之后法院会进行审查，法院会在七日之内决定是否立案，对于符合立案条件的，法院会立案受理，并向被告送达起诉状，然后被告要进行答辩。
（三）接下来原告收到法院的立案通知后要交纳诉讼费。
（四）进行调解，如果在庭前调解的环节调解成功了，则法院不再安排开庭审理。
（五）调解失败的法院安排开庭审理。
（六）法院经过审理后认定夫妻感情已经破裂的就会判决准予离婚，反之就会判决不准离婚。
如果双方都同意离婚的，选择了协议离婚的方式离婚的，需要下列手续：
（一）双方就离婚问题达成一致，并就财产分割、子女抚养等问题协商好，并写一份离婚协议书。
（二）双方亲自到一方住所地的婚姻登记机关提出离婚申请。
（三）经过离婚冷静期。婚姻登记机关收到离婚登记申请之日起三十日内，任何一方不愿意离婚的，可以向婚姻登记机关撤回离婚登记申请，这就是离婚冷静期。
（四）三十天后，双方应当亲自到婚姻登记机关申请发给离婚证；未申请的，视为撤回离婚登记申请。
（五）婚姻登记机关查明双方确实是自愿离婚，并已经对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的，予以登记，发给离婚证。

《民法典》第一千零七十六条
夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。