关于房屋面积差额价款补偿的计算方式如下：当差额未超过总面积的3%时，应以实际测量的数据为基础，确认房价款；
然而，如果超过了这个阈值，买方可选择终止合同，卖方需退还已支付的购房款项及其相应利息；若买方选择维持合同效力并要求继续履行，则可根据面积差异幅度以及事先约定的房价标准，来确定由买方额外补足款项、卖方独自承担此笔费用，或是卖方将不足房款返还给买方并给予其双倍赔偿。

《商品房销售管理办法》第二十条
按套内建筑面积或者建筑面积计价的，当事人应当在合同中载明合同约定面积与产权登记面积发生误差的处理方式。合同未作约定的，按以下原则处理：
（一）面积误差比绝对值在3%以内的，据实结算房价款；
（二）面积误差比绝对值超出3%时，买受人有权退房。买受人不退房的，产权登记面积大于合同约定面积时，面积误差比在3%以内部分的房价款由买受人补足；超出3%部分的房价款由房地产开发企业承担，产权归买受人。产权登记面积小于合同约定面积时，面积误差比绝对值在3%以内部分的房价款由房地产开发企业返还买受人；绝对值超出3%部分的房价款由房地产开发企业双倍返还买受人。