关于违约行为的问题。在此种情形下，合同的一方当事人未能按时交付房屋，长达三个月之久，这种做法显然已经严重违背了协议中制定的相关规定和条款。因此，这个当事人必须要承担相应的法律后果，即恢复原状、采取有效整改措施以弥补影响、亦或是给予对方相应的经济补偿以及支付罚金等方式来解决这一问题。如果在协议中有明确规定逾期付款需支付违约金的话，那么违约方在依照规定支付了违约金之后，仍然需要无条件地完成自己的义务。

《民法典》第五百八十五条当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。