关于房屋合同中违约金的处理方式，当事人如已在协议中有明确设定的，应遵循其约定进行赔偿；若无相关条款说明者，则应依据事实情况对对方作出损失赔偿，具体金额应以违约行为给对方带来的真实损害为参考，同时考虑到合同履行完毕后可能产生的预期收益等因素。此外，需要注意的是，法律对于房屋违约金的赔偿标准也有所规范，即违约方承诺支付的违约金数额不得超出实际损失的百分之三十。若确实存在超额情形，受损方有权向法院或仲裁机构提出申请，要求适当调整违约金的赔偿标准。

《民法典》第五百八十五条当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加;约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。