农村房屋权利人的认定，一般可参照以下几种常见方式：
一、依据房屋登记情况认定
房屋产权登记是确认物权归属和内容的关键依据。
若农村房屋依法进行了产权登记，那么登记记载的权利人就是房屋的权利人。
这是一种最直接、最具法律效力的认定方式。
相关部门在进行登记时，会对房屋的相关信息进行详细核实和记录，包括房屋的位置、面积、结构等，这些信息都与权利人紧密相关。
所以，只要房屋产权登记合法有效，登记的权利人就对该房屋享有相应权利。
二、参考建房审批手续认定
在没有进行房屋产权登记的情况下，建房时的审批手续就成为重要的参考依据。
审批表上会记载申请人、家庭成员等具体信息。
因为建房审批手续是房屋建设合法性的重要证明，上面的信息反映了当时建房的相关情况和权益分配。
三、根据出资建造情况认定
谁出资建造房屋对认定权利人至关重要。
如果能够提供充分证据，证明自己对房屋建造有出资贡献，出资情况体现了权利人在房屋建设过程中的经济投入和权益关联。
四、结合历史使用和居住情况认定
长期稳定地使用、居住该房屋的人员，在没有相反证据的情况下，也有可能被认定为房屋权利人。
因为历史使用和居住情况反映了房屋与相关人员的实际关联和依存关系。

案情回顾:

小朱与小李就农村一处房屋的权利人认定产生争议。该房屋登记在小朱名下，但小李称建房时自己有出资，且自己一家曾长期居住于此，而小朱则拿出建房审批手续，显示自己是申请人。

案情分析:

1、从房屋登记情况看，登记在小朱名下，按照相关规定，登记记载的权利人小朱应是房屋权利人。
2、参考建房审批手续，小朱是申请人，在无房屋产权登记时，这也倾向于认定小朱为权利人。
3、关于出资建造情况，小李称有出资，若能提供充分出资证据，其对房屋可能享有相应权利。
4、结合历史使用和居住情况，小李一家长期居住，若无相反证据，其也可能被认定为权利人，需综合判断。