在房产交易或持有过程中，有时会遇到权属不清的情况。
针对这种情况，可按以下方式妥善处理：
1.协商解决：
相关权益人首先可以尝试自行协商来明确房产归属。
这就需要各方心平气和地坐下来，仔细梳理房产相关的各种情况，比如当初购房时的约定、各自的出资情况等。
若协商达成一致意见，应当签订详细且具有法律效力的相关协议，明确各方的权利和义务。
之后，要按照规定办理产权变更登记手续，确保房产的权属在法律上得到准确的认定。
2.申请确权：
要是协商无法达成一致，权益人可以向不动产所在地的人民法院提起确权之诉。
在这个过程中，法院会依据一系列相关证据来依法确定房产的真实权属。
这些证据包括购房合同，要查看合同中的条款是否明确；付款凭证，确认款项的支付情况；还有房产来源证明等，全面、细致地审查房产的来龙去脉。
3.行政途径：
在某些特定情况下，例如因登记错误导致权属不清，权益人可向不动产登记机构申请更正登记。
若登记机构拒绝更正，权益人可申请行政复议或提起行政诉讼，通过合法的行政程序来解决问题。
在处理权属不清的房产时，要注重收集和保留各类相关证据，这样才能有力地支持自己的主张。
同时，必须严格遵循法定程序，通过合法途径解决纠纷，切实保障自身权益。

案情回顾:

小朱和小李共同出资购买了一套房产，但未明确约定房产份额，后因房产增值产生权属争议。小朱主张按出资比例划分，小李则认为应平分。双方先协商，未达成一致；小朱向法院提起确权之诉，法院审理中，又发现存在登记错误问题。

案情分析:

1、协商阶段，双方未能就房产归属达成一致意见，未签订明确权利义务的协议，也就无法办理产权变更登记手续。
2、确权之诉中，法院会依据购房合同、付款凭证等证据确定真实权属，但因出现登记错误，情况变得复杂。
3、针对登记错误，若登记机构拒绝更正，小朱或小李可申请行政复议或提起行政诉讼来解决。