父亲将厂房变更给儿子，常见的方式主要有以下两种：
1.买卖方式：
当厂房具备合法产权时，父子双方可以选择通过买卖的形式完成变更。
首先，双方需要签订一份详细的厂房买卖合同。
在这份合同中，要明确约定诸如厂房的具体位置、面积、交易价格、付款方式以及交付时间等关键信息。
父亲作为卖方，儿子作为买方，需按照合同所约定的内容，由儿子向父亲支付相应的价款。
接下来，就是办理产权过户登记手续。
在办理时，需要向相关部门提交一系列的材料，包括双方的身份证明，用以证明各自的身份信息；厂房产权证明，明确厂房的产权归属；以及双方签订的买卖合同等。
相关部门在收到这些材料后，会进行严谨的审核，审核通过后，便会完成厂房产权的变更登记。
2.赠与方式：
父亲若打算将厂房无偿赠与儿子，那么父子双方需签订赠与合同，在合同中清晰表明父亲将厂房赠与儿子的意愿。
之后，双方需共同向相关部门提出办理产权变更登记的申请。
申请时，同样要提供赠与合同、双方的身份证明以及厂房产权证明等必要材料。

在整个厂房产权变更的过程中，还可能会涉及到税费缴纳等一系列问题。
为了确保变更过程合法合规，建议父子双方提前向当地的不动产登记部门以及税务部门进行详细的咨询，了解清楚相关的政策和流程。

案情回顾:

小朱欲将自己的厂房变更给儿子小李，考虑买卖和赠与两种方式。小朱与小李先签买卖合同约定交易细节，小李付款后办理过户，但因材料不齐被退回。后考虑赠与方式，签订赠与合同申请变更，又因税费问题产生争议。

案情分析:

1、采用买卖方式时，双方签订的合同应明确关键信息，确保交易细节清晰，提交过户材料要齐全，避免因材料问题影响产权变更登记。
2、选择赠与方式，虽无需支付价款，但仍需按规定提供相关材料，且对于涉及的税费问题，应提前咨询相关部门，确保变更合法合规。