购买经济适用房主要存在以上三种风险：
1、借名购买经济适用房
即实际购买人不具备购房资格，以符合购房条件的其他人名义进行购房。
这类购房行为将被认为侵犯城市低收入住房困难家庭的平等购房和获得房屋的权利，非法占有社会公共资源，使国家的有关土地、房产税费流失，损害了社会公共利益，从而构成无效买卖合同。
2、未满5年即交易
《经济适用住房管理办法》第三十三条，经济适用房购房人拥有有限的产权。
购买经济适用住房不满5年，不得直接上市交易，购房人因特殊原因需转让经济适用住房的，可由政府按照规定进行回购。
因此，如果经济适用房的购房者在取得房屋契税完税凭证及房屋所有权证尚不满5年的情况下，将房屋出售给其他人，相应的买卖合同一般会被认为违反了已购经济适用房不满5年不得直接上市交易的政策规定而无效。
3、无法过户登记的情形
购房者在取得房屋契税完税凭证及房屋所有权证之后满5年的，可以按照政府标准向政府交纳土地收益等价款，取得完全产权。
此时，购房者转让经济适用房的，政府住房保障管理部门可以优先购买，此为强制性规定。
若是政府住房保障管理部门未放弃回购，购房者则无权私自转让房屋，否则后续亦无法过户登记给其他人。
若是政府住房保障管理部门放弃回购，出具同意上市出售的书面意见，购房者方可将其房屋按照市场价格上市交易。

《民法典》第二百零八条
不动产物权的设立、变更、转让和消灭，应当依照法律规定登记。动产物权的设立和转让，应当依照法律规定交付。