会的。
根据最新发布的《关于调整住房公积金个人住房贷款政策的通知》，只要在银行征信系统中有过贷款记录，均被认定为二套。第几套房与是否全款无关，其认定为以家庭为单位，所拥有的住房。
契税按照购房时情况来缴纳，是按照一套房缴纳。一套房和二套房和你单身、结婚并没有关系，是看名下房产套数。