在涉及到商业合同纠纷中的特殊情况下，我们必须认真关注对方公司是否已经进入破产程序或者直接进行清算以及随之而来的注销环节。
假如对方公司已经启动了破产程序，那么请务必抓紧时间向破产管理机构申报您的债权，并遵守相关法律法规的规定，积极参与债权分配环节。
值得注意的是，在债务分配的问题上，破产债权会受到诸多因素的影响，债务的清偿顺序也有着明确的规定，诸如：
首先需要清偿的是破产程序中所产生的各项费用与共同利益义务，之后才有序地偿还职工债权、社保费用以及税款等。
然而，普通债权在大多数情况下，将会按照一定比例进行分配处理。
最后但并非最不重要的就是，如果对方公司选择直接进行清算并且完成注销流程的话，那么就需要仔细审查公司的清算过程是否符合法律法规的严格要求。
在某些极端情况下，如果发现公司并没有按照相关规定进行清算就擅自注销，那么您是有权追究公司股东的相应责任的。
总而言之，为了有效保障自己的合法权益，请尽可能快速、准确且完整地收集和固定各种相关证据，这其中包括合同本身及其执行情况的证据等等。